Новый метод борьбы с раком кишечника может помочь нижегородским онкологам

Нижний Новгород. 11 августа. NewsRoom24.ru - Российские ученые предложили новый вычислительный метод для поиска перспективных мишеней при лечении рака толстой и прямой кишки. Разработка может представлять интерес и для нижегородской онкологии, поскольку в перспективе способна помочь в подборе более точной терапии.

Исследователи Центрального университета создали алгоритм, анализирующий сразу несколько типов биологических данных. Он позволяет за несколько часов выделить участки генома, которые могут играть важную роль в развитии опухоли.

Одной из задач ученых стала борьба с устойчивостью раковых клеток к терапии. Для этого специалисты изучили длинную некодирующую РНК SNHG1, уровень которой связан с активностью генов, участвующих в росте опухоли.

Алгоритм одновременно учитывает физические контакты между РНК и ДНК, метки активности генов и расположение суперэнхансеров — участков генома, способных значительно усиливать работу генов.

В результате исследователи сократили перечень из тысяч потенциальных вариантов до 12 наиболее перспективных генов-мишеней. Их активность оказалась повышенной в опухолевых тканях по сравнению со здоровыми. Сам уровень SNHG1 в образцах опухолей был более чем втрое выше. Для анализа использовали данные свыше 500 образцов.

По словам авторов, разработка работает как своеобразный «навигатор по геному»: вместо длительного перебора вариантов исследователи получают небольшой перечень направлений для дальнейшей проверки.

В перспективе подобная технология может использоваться при разработке персонализированных подходов к лечению, в том числе помогать определять, какая терапия потенциально окажется эффективнее для конкретного пациента.

При этом авторы подчеркивают, что пока речь идет о результатах вычислительного исследования. Выявленные закономерности и потенциальные мишени должны пройти экспериментальную проверку.

Агентство новостей «НЬЮСРУМ24» в ВК

Фото: из открытых источников